２０１６年１１月２６日至１２月２６日，中央第三環境保護督察組對湖北省開展環境保護督察。督察認為，湖北省高度重視環境保護工作，２０１６年出臺湖泊保護、濕地管理、水污染防治、土壤污染防治、秸稈禁燒等多項地方性環保法規，加強環保督政。
截至２０１７年２月，督察組交辦的１９２５件環境問題舉報已全部辦結，責令整改９１７家，立案處罰３５９家，行政拘留２３人，刑事拘留５人，問責５２２人，約談９４５人。
然而，全省環境保護形勢依舊嚴峻，環境保護工作力度與中央要求和群眾期盼尚有差距。督察反饋會通報稱，湖北全省共建成水庫６２７５座，水電站１７８８座，漢江在流量減少的情況下，仍實施六級梯級開發，干流流速降低，水體自凈能力下降，近年來年年發生水華。江漢平原水系發達，但上下游各自為政，建設各類涵閘、水壩上萬座，水資源、水污染糾紛不斷。
填湖占湖問題依然存在，武漢官蓮湖西北部１０個湖邊塘、硃山湖北部近２００畝水面、湯遜湖約１４５畝湖邊塘均屬湖北省湖泊保護條例規定應予保護的水域，但全部被劃出保護范圍，并作為建設用地出讓，在２０１３年以后被陸續填占用于工業和房地產開發。
湖泊非法養殖污染突出。洪湖作為國家級自然保護區，管理部門長期以漁業收費代替漁政執法，截至２０１６年１１月拆圍前，珍珠養殖面積達９９５０畝，圍網養殖達１５．５萬畝，水質從２０１１年的Ⅱ類惡化到２０１６年的Ⅳ類。
長江環境保護形勢不容樂觀。湖北全省長江支流總體呈現“好水變少、差水增多”的趨勢。沿江部分重化工企業環境違法問題突出，沿江８市（州）８７個工業園區，近５０％未配套建設集中式污水處理廠。
督察要求，湖北省各級黨委和政府正確處理水資源開發與水環境保護關系，推進水生態環境持續改善，堅決推進長江大保護，著力加強干流、主要支流和重要湖庫環境綜合整治，并將整改落實情況及時向社會公開。
